CY花菁染料的优缺点，你知道多少？

花菁这类染料的分子内部含有由甲川基(CH)n组成的共轭链，n可为奇数或偶数。共轭链两端或链中间连有杂环、芳环化合物、环烯化合物等与共轭链组成一个大的共轭体系，分子内部的氢可被一定数目的各类取代基取代。

由于其结构，花菁具有非常高的消光系数。不同的取代基可控制发色团的性质，例如吸收波长，光稳定性和荧光等。吸光度和荧光波长可通过选择聚次甲基桥的长度来控制：更长的花菁素具有较高的吸光度和发射波长，直至近红外区域。

一、CY花菁染料分类：
花菁染料有两种：非磺化花菁和磺化花菁。在许多应用中，它们是可互换的，因为它们的光谱特性几乎相同。磺化和非磺化染料均可用于标记生物分子，例如DNA和蛋白质。染料之间的区别在于它们的溶解度：硫化染料是水溶性的，并且它们在水性环境中不使用有机助溶剂进行标记。它们不易在水中聚集。在某些情况下，需要使用一种类型的花菁。

1.非磺化花菁：包括Cy3，Cy3.5，Cy5，Cy5.5，Cy7和Cy7.5。

CY3/CY3.5/CY5/CY5.5/CY7.5
菁染料是近红外荧光染料中最常用的一类荧光染料，统的可见光染料相比有显著的优势。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段最小，因此在检测复杂生物系统时，近红外染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时，由于光波在近红外区段的组织透过性更好。菁染料的摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的，Cy7 NHS ester,Cy5.5 amine和Cy3 azide的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。


2.磺化花菁：
磺化花菁包括促进染料分子在水相中溶解的其他磺基。带电的磺酸盐基团减少了染料分子和重度标记的结合物的聚集。当前可用的磺化花菁包括磺基-Cy3，磺基-Cy5和磺基-Cy7。

二、CY花菁染料的优点：
1：菁染料的摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的
2：细胞和组织的自发荧光在近红外波段最小
3：更高的特异性和灵敏度
4：光波在近红外区段的组织透过性更好
5：染料细胞毒性小 可用于标记抗体 蛋白 细胞。
因此CY花菁染料是非常适合做小鼠活体成像的荧光染料
 
三、CY花菁染料的缺点：
1：菁染料的荧光量子效率相比其他染料较低，一般是0.1-0.2
2：多川结构的菁染料容易发生聚集
 
四、CY花菁染料的特点：

目前市面上的菁染料价格比较高，主要是因为菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难，因此带磺酸根的水溶花菁染料比脂溶贵一些。