生信作图神器circos的Windows系统安装

首先下载strawberry

circos是perl语言编写的，所以一定要先下载perl。推荐下载strawberry Perl。这个就正常下一步下一步安装完成，之后再cmd 中测试，如图安装成功。

之后可以在Perl中输入

cpan Carp Clone Config::General Cwd Data::Dumper Digest::MD5 File::Basename File::Spec::Functions File::Temp FindBin Font::TTF::Font GD GD::Image Getopt::Long IO::File List::MoreUtils List::Util Math::Round Math::Trig Math::VecStat Memoize Params::Validate Pod::Usage POSIX Readonly Regexp::Common Statistics::Basic Storable Sys::Hostname Text::Balanced Text::Format Time::HiRes

下载一些必要的模块，等待安装的时候可以先进行下面步骤。

去circos官网下载

http://circos.ca/software/download/
最新版的就行，下载完放在适当的文件夹中解压。（在此推荐7-zip解压工具）

环境变量

我会将circos文件夹里面的bin 添加到用户path变量中，这样一打开Perl不用再cd 就可以直接执行circos命令。

最后

在perl 中输入circos - conf D:\Software\circos\circos-0.69-9\example\etc\circos.conf

运行后，一般在文档中可以找到新生成的两个文件，点开就是生成的图片。