K-means算法在Python中的实现
K-MEANS算法是输入聚类个数k,以及包含 n个数据对象的数据库,输出满足方差最小标准k个聚类的一种算法。k-means 算法接受输入量 k ;然后将n个数据对象划分为 k个聚类以便使得所获得的聚类满足:同一聚类中的对象相似度较高;而不同聚类中的对象相似度较小。本文将和大家介绍K-means算法在Python中的实现。
核心思想
通过迭代寻找k个类簇的一种划分方案,使得用这k个类簇的均值来代表相应各类样本时所得的总体误差最小。
k个聚类具有以下特点:各聚类本身尽可能的紧凑,而各聚类之间尽可能的分开。
k-means算法的基础是最小误差平方和准则,K-menas的优缺点:
优点:
原理简单
速度快
对大数据集有比较好的伸缩性
缺点:
需要指定聚类 数量K
对异常值敏感
对初始值敏感
K-means的聚类过程
其聚类过程类似于梯度下降算法,建立代价函数并通过迭代使得代价函数值越来越小
适当选择c个类的初始中心;
在第k次迭代中,对任意一个样本,求其到c个中心的距离,将该样本归到距离最短的中心所在的类;
利用均值等方法更新该类的中心值;
对于所有的c个聚类中心,如果利用(2)(3)的迭代法更新后,值保持不变,则迭代结束,否则继续迭代。
该算法的最大优势在于简洁和快速。算法的关键在于初始中心的选择和距离公式。
K-means 实例展示
python中km的一些参数:
sklearn.cluster.KMeans( n_clusters=8, init='k-means++', n_init=10, max_iter=300, tol=0.0001, precompute_distances='auto', verbose=0, random_state=None, copy_x=True, n_jobs=1, algorithm='auto' ) n_clusters: 簇的个数,即你想聚成几类 init: 初始簇中心的获取方法 n_init: 获取初始簇中心的更迭次数,为了弥补初始质心的影响,算法默认会初始10个质心,实现算法,然后返回最好的结果。 max_iter: 最大迭代次数(因为kmeans算法的实现需要迭代) tol: 容忍度,即kmeans运行准则收敛的条件 precompute_distances:是否需要提前计算距离,这个参数会在空间和时间之间做权衡,如果是True 会把整个距离矩阵都放到内存中,auto 会默认在数据样本大于featurs*samples 的数量大于12e6 的时候False,False 时核心实现的方法是利用Cpython 来实现的 verbose: 冗长模式(不太懂是啥意思,反正一般不去改默认值) random_state: 随机生成簇中心的状态条件。 copy_x: 对是否修改数据的一个标记,如果True,即复制了就不会修改数据。bool 在scikit-learn 很多接口中都会有这个参数的,就是是否对输入数据继续copy 操作,以便不修改用户的输入数据。这个要理解Python 的内存机制才会比较清楚。 n_jobs: 并行设置 algorithm: kmeans的实现算法,有:'auto', ‘full', ‘elkan', 其中 ‘full'表示用EM方式实现 虽然有很多参数,但是都已经给出了默认值。所以我们一般不需要去传入这些参数,参数的。可以根据实际需要来调用。
下面展示一个代码例子
from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.externals import joblib from sklearn import cluster import numpy as np # 生成10*3的矩阵 data = np.random.rand(10,3) print data # 聚类为4类 estimator=KMeans(n_clusters=4) # fit_predict表示拟合+预测,也可以分开写 res=estimator.fit_predict(data) # 预测类别标签结果 lable_pred=estimator.labels_ # 各个类别的聚类中心值 centroids=estimator.cluster_centers_ # 聚类中心均值向量的总和 inertia=estimator.inertia_ print lable_pred print centroids print inertia 代码执行结果 [0 2 1 0 2 2 0 3 2 0] [[ 0.3028348 0.25183096 0.62493622] [ 0.88481287 0.70891813 0.79463764] [ 0.66821961 0.54817207 0.30197415] [ 0.11629904 0.85684903 0.7088385 ]] 0.570794546829
为了更直观的描述,这次在图上做一个展示,由于图像上绘制二维比较直观,所以数据调整到了二维,选取100个点绘制,聚类类别为3类
from sklearn.cluster import KMeans from sklearn.externals import joblib from sklearn import cluster import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt data = np.random.rand(100,2) estimator=KMeans(n_clusters=3) res=estimator.fit_predict(data) lable_pred=estimator.labels_ centroids=estimator.cluster_centers_ inertia=estimator.inertia_ #print res print lable_pred print centroids print inertia for i in range(len(data)): if int(lable_pred[i])==0: plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='red') if int(lable_pred[i])==1: plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='black') if int(lable_pred[i])==2: plt.scatter(data[i][0],data[i][1],color='blue') plt.show()
可以看到聚类效果还是不错的,对k-means的聚类效率进行了一个测试,将维度扩宽到50维
数据规模 | 消耗时间 | 数据维度 |
---|---|---|
10000条 | 4s | 50维 |
100000条 | 30s | 50维 |
1000000条 | 4'13s | 50维 |
对于百万级的数据,拟合时间还是能够接受的,可见效率还是不错,对模型的保存与其它的机器学习算法模型保存类似
from sklearn.externals import joblib joblib.dump(km,"model/km_model.m")
以上内容就是K-means算法在Python中的实现,希望能帮助到大家。
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