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Rosalind-002:DNA转录为RNA(Transcribing DNA into RNA)

程序员文章站 2022-04-15 18:05:43
题目:DNA转录为RNA(Transcribing DNA into RNA)Given: A DNA string tt, which corresponding to a coding strand, having length at most 1000 nt.所给:一条被命名为tt的DNA编码链,长度至少为1000个碱基。Return: The transcribed RNA string of tt.需得:由tt经转录得到的RNA链。测试数据GATGGAACTTGACTACGTAAAT...

题目:

DNA转录为RNA(Transcribing DNA into RNA)

Given: A DNA string tt, which corresponding to a coding strand, having length at most 1000 nt.

所给:一条被命名为tt的DNA编码链,长度至少为1000个碱基。

Return: The transcribed RNA string of tt.

需得:由tt经转录得到的RNA链。

测试数据

GATGGAACTTGACTACGTAAATT

测试输出

GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU

生物背景

RNA中五碳糖为核糖,碱基有四种,分别为腺嘌呤(adenine,A)、鸟嘌呤(guanine,G)、胞嘧啶(cytosine,C)和尿嘧啶(uracil,U)。信使RNA(mRNA)由DNA的其中一条链转录而来,携带遗传信息并指导蛋白质的合成。转录RNA分子的DNA链称为模板链,另一条链称为编码链。

思路

题目给出的是编码链,因此只用把T替换为U即为转录得到的RNA序列。

Python知识点

DNA序列是一个字符串,Python中针对字符串提供了大量方法可直接调用,其中“.replace()”方法可用于替换字符。

代码

f=open('rosalind_dna.txt','r')
s=f.read()
s1=s.replace('T','U')
print(s1)

作者:wshjlxt
https://www.bilibili.com/read/cv1977567
出处: bilibili

本文地址:https://blog.csdn.net/weixin_43958845/article/details/109633930