Hadoop对文本文件的快速全局排序实现方法及分析
一、背景
hadoop中实现了用于全局排序的inputsampler类和totalorderpartitioner类,调用示例是org.apache.hadoop.examples.sort。
但是当我们以text文件作为输入时,结果并非按text中的string列排序,而且输出结果是sequencefile。
原因:
1) hadoop在处理text文件时,key是行号longwritable类型,inputsampler抽样的是key,totalorderpartitioner也是用key去查找分区。这样,抽样得到的partition文件是对行号的抽样,结果自然是根据行号来排序。
2)大数据量时,inputsampler抽样速度会非常慢。比如,randomsampler需要遍历所有数据,intervalsampler需要遍历文件数与splits数一样。splitsampler效率比较高,但它只抽取每个文件前面的记录,不适合应用于文件内有序的情况。
二、功能
1. 实现了一种局部抽样方法partialsampler,适用于输入数据各文件是独立同分布的情况
2. 使randomsampler、intervalsampler、splitsampler支持对文本的抽样
3. 实现了针对text文件string列的totalorderpartitioner
三、实现
1. partialsampler
partialsampler从第一份输入数据中随机抽取第一列文本数据。partialsampler有两个属性:freq(采样频率),numsamples(采样总数)。
public k[] getsample(inputformat<k,v> inf, jobconf job) throws ioexception { inputsplit[] splits = inf.getsplits(job, job.getnummaptasks()); arraylist<k> samples = new arraylist<k>(numsamples); random r = new random(); long seed = r.nextlong(); r.setseed(seed); log.debug("seed: " + seed); // 对splits【0】抽样 for (int i = 0; i < 1; i++) { system.out.println("partialsampler will getsample splits["+i+"]"); recordreader<k,v> reader = inf.getrecordreader(splits[i], job, reporter.null); k key = reader.createkey(); v value = reader.createvalue(); while (reader.next(key, value)) { if (r.nextdouble() <= freq) { if (samples.size() < numsamples) { // 选择value中的第一列抽样 text value0 = new text(value.tostring().split("\t")[0]); samples.add((k) value0); } else { // when exceeding the maximum number of samples, replace a // random element with this one, then adjust the frequency // to reflect the possibility of existing elements being // pushed out int ind = r.nextint(numsamples); if (ind != numsamples) { text value0 = new text(value.tostring().split("\t")[0]); samples.set(ind, (k) value0); } freq *= (numsamples - 1) / (double) numsamples; } key = reader.createkey(); } } reader.close(); } return (k[])samples.toarray(); }
首先通过inputformat的getsplits方法得到所有的输入分区;
然后扫描第一个分区中的记录进行采样。
记录采样的具体过程如下:
从指定分区中取出一条记录,判断得到的随机浮点数是否小于等于采样频率freq
如果大于则放弃这条记录;
如果小于,则判断当前的采样数是否小于最大采样数,
如果小于则这条记录被选中,被放进采样集合中;
否则从【0,numsamples】中选择一个随机数,如果这个随机数不等于最大采样数numsamples,则用这条记录替换掉采样集合随机数对应位置的记录,同时采样频率freq减小变为freq*(numsamples-1)/numsamples。
然后依次遍历分区中的其它记录。
note:
1)partialsampler只适用于输入数据各文件是独立同分布的情况。
2)自带的三种sampler通过修改samples.add(key)为samples.add((k) value0); 也可以实现对第一列的抽样。
2. totalorderpartitioner
totalorderpartitioner主要改进了两点:
1)读partition时指定keyclass为text.class
因为partition文件中的key类型为text
在configure函数中,修改:
//class<k> keyclass = (class<k>)job.getmapoutputkeyclass(); class<k> keyclass = (class<k>)text.class;
2)查找分区时,改用value查
public int getpartition(k key, v value, int numpartitions) { text value0 = new text(value.tostring().split("\t")[0]); return partitions.findpartition((k) value0); }
3. sort
1)设置inputformat、outputformat、outputkeyclass、outputvalueclass、mapoutputkeyclass
2)初始化inputsampler对象,抽样
3)partitionfile通过cachefile传给totalorderpartitioner,执行mapreduce任务
class<? extends inputformat> inputformatclass = textinputformat.class; class<? extends outputformat> outputformatclass = textoutputformat.class; class<? extends writablecomparable> outputkeyclass = text.class; class<? extends writable> outputvalueclass = text.class; jobconf.setmapoutputkeyclass(longwritable.class); // set user-supplied (possibly default) job configs jobconf.setnumreducetasks(num_reduces); jobconf.setinputformat(inputformatclass); jobconf.setoutputformat(outputformatclass); jobconf.setoutputkeyclass(outputkeyclass); jobconf.setoutputvalueclass(outputvalueclass); if (sampler != null) { system.out.println("sampling input to effect total-order sort..."); jobconf.setpartitionerclass(totalorderpartitioner.class); path inputdir = fileinputformat.getinputpaths(jobconf)[0]; inputdir = inputdir.makequalified(inputdir.getfilesystem(jobconf)); //path partitionfile = new path(inputdir, "_sortpartitioning"); totalorderpartitioner.setpartitionfile(jobconf, partitionfile); inputsampler.<k,v>writepartitionfile(jobconf, sampler); uri partitionuri = new uri(partitionfile.tostring() + "#" + "_sortpartitioning"); distributedcache.addcachefile(partitionuri, jobconf); distributedcache.createsymlink(jobconf); } filesystem hdfs = filesystem.get(jobconf); hdfs.delete(outputpath); hdfs.close(); system.out.println("running on " + cluster.gettasktrackers() + " nodes to sort from " + fileinputformat.getinputpaths(jobconf)[0] + " into " + fileoutputformat.getoutputpath(jobconf) + " with " + num_reduces + " reduces."); date starttime = new date(); system.out.println("job started: " + starttime); jobresult = jobclient.runjob(jobconf);
四、执行
usage:
hadoop jar yitengfei.jar com.yitengfei.sort [-m <maps>] [-r <reduces>]
[-splitrandom <double pcnt> <numsamples> <maxsplits> | // sample from random splits at random (general)
-splitsample <numsamples> <maxsplits> | // sample from first records in splits (random data)
-splitinterval <double pcnt> <maxsplits>] // sample from splits at intervals (sorted data)
-splitpartial <double pcnt> <numsamples> <maxsplits> | // sample from partial splits at random (general) ]
<input> <output> <partitionfile>
example:
hadoop jar yitengfei.jar com.yitengfei.sort -r 10 -splitpartial 0.1 10000 10 /user/rp-rd/yitengfei/sample/input /user/rp-rd/yitengfei/sample/output /user/rp-rd/yitengfei/sample/partition
五、性能
200g输入数据,15亿条url,1000个分区,排序时间只用了6分钟
总结
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