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Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

程序员文章站 2022-03-23 14:05:55
目录1. 预先准备源文件示例func.cpp头文件示例test_h.h2. 创建r包步骤新建r packager包的文件结构修改description文件3. c++11标准问题1. 预先准备wind...

1. 预先准备

windows下需要安装rtools,r中装好rcpp和rcpparmadillo。创建c++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h

源文件示例func.cpp

// [[rcpp::depends(rcpparmadillo)]]
// [[rcpp::plugins(cpp11)]]
#include <rcpparmadillo.h>
#include <vector>
#include "./test_h.h"

using namespace rcpp;
using namespace std;
// using namespace arma;

// [[rcpp::export]]
robject func(){
  arma::cube a(3,4,5,arma::fill::randu);
  std::cout<<condit<<std::endl;
  return wrap(a);
}

// [[rcpp::depends(rcpparmadillo)]]:用于指明需要使用rcpparmadillo。

// [[rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用c++11。

#include "./test_h.h":表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来,并加上.h./表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。

// using namespace arma;不一定有用。如果要用armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::

func()函数将可以直接在r中调用。

头文件示例test_h.h

#include <iostream>
#define condit 1000

2. 创建r包步骤

新建r package

Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

选择package w/rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到src文件夹下。

Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

r包的文件结构

Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

修改description文件

将rcpparmadillo添加进imports和linkingto中。

package: rcpppacktest
type: package
title: what the package does (title case)
version: 0.1.0
author: who wrote it
maintainer: the package maintainer <yourself@somewhere.net>
description: more about what it does (maybe more than one line)
    use four spaces when indenting paragraphs within the description.
license: what license is it under?
encoding: utf-8
lazydata: true
imports: rcpp (>= 0.12.11), rcpparmadillo
linkingto: rcpp, rcpparmadillo

build & reload 建立包

3. c++11标准问题

如果要使用c++11标准,第一种方法是在makevars文件中添加如下代码:

cxx = g++-4.8.1
pkg_cxxflags = -std=c++11

第二种方法是在.cpp文件前添加// [[rcpp::plugins(cpp11)]]

以上就是rcpp和rcpparmadillo创建r包实现方式的详细内容,更多关于rcpp和rcpparmadillo创建r包的资料请关注其它相关文章!