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如何安装SRAdb?

程序员文章站 2024-03-16 13:34:16
...

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

 biocLite("SRAdb")

ps:如果安装失败,提示版本不正确的话,记得更新为它需要的版本

library(SRAdb)

srafile = getSRAdbFile()

con = dbConnect('SQLite',srafile)

Now we are ready to query the local SQLite database:

listSRAfile('SRP026197',con)

如何安装SRAdb?

参考来源:https://www.biostars.org/p/93494/

相关标签: NCBI SRA