php执行shell脚本，得到标准输出和错误输出

1.问题

在php代码中需要执行一个shell脚本，希望分别得到它的标准输出(stdout)和错误输出(stderr)。用shell的重定向把标准输出和错误输出放到文件中再用php读取文件，可行，但输出文件的内容传回php后就不再需要，有没有办法把shell的输出重定向到变量？

要执行脚本的功能,无法用php本身完成（执行R语言的脚本),并且需要把常规输出和错误输出都反馈。

2.已有尝试

shell里面的重定向可以把标准输出和错误输出分别放到文件中，但产生临时文件。

my_cmd 1>out.txt 2>err.txt

php再读取out.txt和err.txt文件内容进行返回。

这样做的缺点：产生了中间文件。如果shell命令my_cmd执行的时间比较长（可能要几分钟），那么同一用户如果短时间内多次发起http请求使得php执行my_cmd，则需要每次out.txt和err.txt的名字都不同，以免写入冲突。这就产生了很多不必要的中间文件。即使及时删除它们，对于I/O还是有开销，希望能避免。

php的exec()函数：

string exec ( string $command [, array &$output [, int &$return_var ]] )

里面的参数$output看起来只能得到“运行脚本时屏幕输出”的内容，是stdout或者stdout和stderr的混合，不能分开获得。