RDKit | 基于片段的分子生成(骨架A+骨架B)
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2022-03-15 14:54:25
环境Win10RDKit2020.09.1Python=3.7.9基于双片段的分子生成导入库import numpy as npfrom rdkit import rdBase, Chemfrom rdkit.Chem import AllChem, Draw, BRICS, Descriptorsfrom rdkit.ML.Descriptors import MoleculeDescriptorsprint(rdBase.rdkitVersion)......
- 通过BRICS算法产生片段库
- 通过结合两个片段(A,B)生成了一个新分子(AB)。
环境
- Win10
- RDKit2020.09.1
- Python=3.7.9
基于双片段的分子生成
导入库
import numpy as np
from rdkit import rdBase, Chem
from rdkit.Chem import AllChem, Draw, BRICS, Descriptors
from rdkit.ML.Descriptors import MoleculeDescriptors
print(rdBase.rdkitVersion)
2020.09.1
载入数据
suppl = Chem.SDMolSupplier('logSdataset1290_2d.sdf')
mols_list = [mo
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