画光谱图——R语言graphics包matplot等函数
程序员文章站
2022-07-14 15:50:15
...
由于前几天一直找如何将光谱图画出,为二分类光谱数据,找了半天,,,,
最后在循环的条件下,一条条画完,,,,,,
最近在prospectr包中忽然发现matplot等函数
数据格式
原始数据处理
##设置读取数据位置
setwd("C:/Users/chengdehe/Desktop/processing")
##读取数据
data <- read.csv("H3.csv",check.names=F)
##去除表头,只剩下光谱数据
data_ref <- data[ ,-(1:2)]
光谱预处理
#####S_G处理进行光谱平滑#####
SG <- savitzkyGolay(data_ref, p = 3, w = 11, m = 0)
处理前后光谱对比——即将两种光谱图画到统一坐标系中
###画原始数据
matplot(as.numeric(colnames(data_ref)), t(data_ref[ , ]),
type = 'l', xlab = 'Wavelength', ylab = 'Absorbance',col="red")
###画处理后数据
matlines(as.numeric(colnames(SG)),t(SG[ , ]),
lty = 1,,col="blue")
###as.numeric(colnames(data_ref))将光谱列表头,即光谱波长转换为数值,作为X轴
同样也可以将转换数据换为,二分类结果,只是需要提前将数据集分开,分别赋值
原始光谱图
叠加光谱图
从图可见转换前后并无太大变化
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