Python使用Zero-Copy和Buffer Protocol实现高性能编程
无论你程序是做什么的,它经常都需要处理大量的数据。这些数据大部分表现形式为strings(字符串)。然而,当你对字符串大批量的拷贝,切片和修改操作时是相当低效的。为什么?
让我们假设一个读取二进制数据的大文件示例,然后将部分数据拷贝到另外一个文件。要展示该程序所使用的内存,我们使用,一个强大的python包,让我们可以一行一行观察程序所使用的内存。
@profile def read_random(): with open("/dev/urandom", "rb") as source: content = source.read(1024 * 10000) content_to_write = content[1024:] print(f"content length: {len(content)}, content to write length {len(content_to_write)}") with open("/dev/null", "wb") as target: target.write(content_to_write) if __name__ == "__main__": read_random()
使用memory_profiler模块来执行以上程序,输出如下:
$ python -m memory_profiler example.py content length: 10240000, content to write length 10238976 filename: example.py line # mem usage increment line contents ================================================ 1 14.320 mib 14.320 mib @profile 2 def read_random(): 3 14.320 mib 0.000 mib with open("/dev/urandom", "rb") as source: 4 24.117 mib 9.797 mib content = source.read(1024 * 10000) 5 33.914 mib 9.797 mib content_to_write = content[1024:] 6 33.914 mib 0.000 mib print(f"content length: {len(content)}, content to write length {len(content_to_write)}") 7 33.914 mib 0.000 mib with open("/dev/null", "wb") as target: 8 33.914 mib 0.000 mib target.write(content_to_write)
我们通过source.read从/dev/unrandom加载了10 mb数据。python需要大概需要分配10 mb内存来以字符串存储这个数据。之后的content[1024:]指令越过开头的一个单位的kb数据进行数据拷贝,也分配了大概10 mb。
这里有趣的是在哪里呢,也就是构建content_to_write时10 mb的程序内存增长。切片操作拷贝了除了开头的一个单位的kb其他所有的数据到一个新的字符串对象。
如果处理类似大量的字节数组对象操作那是简直就是灾难。如果你之前写过c语言,在使用memcpy()需要注意点是:在内存使用以及总体性能来说,复制内存很慢。
然而,作为c程序员的你,知道字符串其实就是由字符数组构成,你不非得通过拷贝也能只处理部分字符,通过使用基本的指针运算——只需要确保整个字符串是连续的内存区域。
在python同样提供了buffer protocol实现。buffer protocol定义在pep 3118,描述了使用c语言api实现各种类型的支持,例如字符串。
当一个对象实现了该协议,你就可以使用memoryview类构造一个memoryview对象引用原始内存对象。
>>> s = b"abcdefgh" >>> view = memoryview(s) >>> view[1] 98 >>> limited = view[1:3] >>> limited <memory at 0x7f6ff2df1108> >>> bytes(view[1:3]) b'bc'
注意:98是字符b的acsii码
在上面的例子中,在使用memoryview对象的切片操作,同样返回一个memoryview对象。意味着它并没有拷贝任何数据,而是通过引用部分数据实现的。
下面图示解释发生了什么:
因此,我们可以将之前的程序改造得更加高效。我们需要使用memoryview对象来引用数据,而不是开辟一个新的字符串。
@profile def read_random(): with open("/dev/urandom", "rb") as source: content = source.read(1024 * 10000) content_to_write = memoryview(content)[1024:] print(f"content length: {len(content)}, content to write length {len(content_to_write)}") with open("/dev/null", "wb") as target: target.write(content_to_write) if __name__ == "__main__": read_random()
我们再一次使用memory profiler执行上面程序:
$ python -m memory_profiler example.py content length: 10240000, content to write length 10238976 filename: example.py line # mem usage increment line contents ================================================ 1 14.219 mib 14.219 mib @profile 2 def read_random(): 3 14.219 mib 0.000 mib with open("/dev/urandom", "rb") as source: 4 24.016 mib 9.797 mib content = source.read(1024 * 10000) 5 24.016 mib 0.000 mib content_to_write = memoryview(content)[1024:] 6 24.016 mib 0.000 mib print(f"content length: {len(content)}, content to write length {len(content_to_write)}") 7 24.016 mib 0.000 mib with open("/dev/null", "wb") as target: 8 24.016 mib 0.000 mib target.write(content_to_write)
在该程序中,source.read仍然分配了10 mb内存来读取文件内容。然而,使用memoryview来引用部分内容时,并没有额外在分配内存。
相比之前的版本,这里节省了大概50%的内存开销。
该技巧,在处理sockets通信的时候极其有用。当通过socket发送数据时,所有的数据可能并没有在一次调用就发送。
import socket s = socket.socket(…) s.connect(…) # build a bytes object with more than 100 millions times the letter `a` data = b"a" * (1024 * 100000) while data: sent = s.send(data) # remove the first `sent` bytes sent data = data[sent:] <2>
使用如下实现,程序一次次拷贝直到所有的数据发出。通过使用memoryview,可以实现zero-copy(零拷贝)方式来完成该工作,具有更高的性能:
import socket s = socket.socket(…) s.connect(…) # build a bytes object with more than 100 millions times the letter `a` data = b"a" * (1024 * 100000) mv = memoryview(data) while mv: sent = s.send(mv) # build a new memoryview object pointing to the data which remains to be sent mv = mv[sent:]
在这里就不会发生任何拷贝,也不会在给data分配了100 mb内存之后再分配多余的内存来进行多次发送了。
目前,我们通过使用memoryview对象实现高效数据写入,但在某些情况下读取也同样适用。在python中大部分 i/o 操作已经实现了buffer protocol机制。在本例中,我们并不需要memoryview对象,我可以请求 i/o 函数写入我们预定义好的对象:
>>> ba = bytearray(8) >>> ba bytearray(b'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00') >>> with open("/dev/urandom", "rb") as source: ... source.readinto(ba) ... 8 >>> ba bytearray(b'`m.z\x8d\x0fp\xa1')
通过该机制,我们可以很简单写入到预定义的buffer中(在c语言中,你可能需要多次调用malloc())。
适用memoryview,你甚至可以将数据放入到内存区域任意点:
>>> ba = bytearray(8) >>> # reference the _bytearray_ from offset 4 to its end >>> ba_at_4 = memoryview(ba)[4:] >>> with open("/dev/urandom", "rb") as source: ... # write the content of /dev/urandom from offset 4 to the end of the ... # bytearray, effectively reading 4 bytes only ... source.readinto(ba_at_4) ... 4 >>> ba bytearray(b'\x00\x00\x00\x00\x0b\x19\xae\xb2')
buffer protocol是实现低内存开销的基础,具备很强的性能。虽然python隐藏了所有的内存分配,开发者不需要关系内部是怎么样实现的。
可以再去了解一下array模块和struct模块是如何处理buffer protocol的,zero copy操作是相当高效的。
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