聚类算法

 infi-chu:

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一、简介

1.聚类算法的应用领域

• 用户画像，广告推荐，data segmentation，搜索引擎的流量推荐，恶意流量识别
• 基于位置信息的商业推送，新闻聚类，筛选排序
• 图像分割，降维，识别；离群点检测；信用卡异常消费；发掘相同功能的基因片段

2.聚类算法

一种典型的无监督学习算法，主要用于将相似的样本自动归到一个类别中。

在聚类算法中根据样本之间的相似性，将样本规划到不同的类别中，对于不同的相似度计算方法，会得到不同的聚类结果。

3.聚类算法与分类算法的区别

聚类算法是无监督学习算法，

分类算法属于监督学习算法。

 

二、聚类算法api

1.api

sklearn.cluster.kmeans(n_clusters=8)

• 参数:
  • n_clusters:开始的聚类中心数量
    • 整型，缺省值=8，生成的聚类数，即产生的质心（centroids）数。
• 方法:
  • estimator.fit(x)
  • estimator.predict(x)
  • estimator.fit_predict(x)
    • 计算聚类中心并预测每个样本属于哪个类别,相当于先调用fit(x),然后再调用predict(x)

 

三、聚类算法实现流程

1.步骤

• 随机设置k个特征空间内的点作为初始的聚类中心
• 对于其他每个点计算到k个中心的距离，未知的点选择最近的一个聚类中心点作为标记类别
• 重新计算每个聚类的新中心（平均值）
• 如果计算得出的新中心与原点中心一样（质心不在移动），则结束，否则重新进行第二步的过程

2.总结

流程:

• 事先确定常数k，常数k意味着最终的聚类类别数;
• 首先随机选定初始点为质心，并通过计算每一个样本与质心之间的相似度(这里为欧式距离)，将样本点归到最相似的类中，
• 接着，重新计算每个类的质心(即为类中心)，重复这样的过程，直到质心不再改变，
• 最终就确定了每个样本所属的类别以及每个类的质心。

注意:

• 由于每次都要计算所有的样本与每一个质心之间的相似度，故在大规模的数据集上，k-means算法的收敛速度比较慢。

 

四、模型评估

1.误差平方和（sse\the sum of squares due to error）

eg.

如图中数据（-0.2,0.4,-0.8,1.3-0.7，均为真实值和预测值的差）

 

 

 在k-means中的应用：

 

 

 公式各部分内容：

 

 

 【注】

上图中: k=2

• sse图最终的结果,对图松散度的衡量.(eg: sse(左图)<sse(右图))

• sse随着聚类迭代,其值会越来越小,直到最后趋于稳定
• 如果质心的初始值选择不好,sse只会达到一个不怎么好的局部最优解.

2.“肘”方法（elbow method）——k值确定

（1）对于n个点的数据集，迭代计算k from 1 to n，每次聚类完成后计算每个点到其所属的簇中心的距离的平方和；

（2）平方和是会逐渐变小的，直到k==n时平方和为0，因为每个点都是它所在的簇中心本身。

（3）在这个平方和变化过程中，会出现一个拐点也即“肘”点，下降率突然变缓时即认为是最佳的k值。

在决定什么时候停止训练时，肘形判据同样有效，数据通常有更多的噪音，在增加分类无法带来更多回报时，我们停止增加类别。

3.轮廓系数法（silhouette coefficient）

结合了聚类的凝聚度（cohesion）和分离度（separation），用于评估聚类的效果：

 

 

 目的：

内部距离最小化，外部距离最大化

 

 

 

计算样本i到同簇其他样本的平均距离ai，ai 越小样本i的簇内不相似度越小，说明样本i越应该被聚类到该簇。

计算样本i到最近簇cj 的所有样本的平均距离bij，称样本i与最近簇cj 的不相似度，定义为样本i的簇间不相似度：bi =min{bi1, bi2, ..., bik}，bi越大，说明样本i越不属于其他簇。

求出所有样本的轮廓系数后再求平均值就得到了平均轮廓系数。

平均轮廓系数的取值范围为[-1,1]，系数越大，聚类效果越好。

簇内样本的距离越近，簇间样本距离越远

eg.

下图是500个样本含有2个feature的数据分布情况，我们对它进行sc系数效果衡量：

 

 

 

n_clusters = 2 the average silhouette_score is : 0.7049787496083262

n_clusters = 3 the average silhouette_score is : 0.5882004012129721

n_clusters = 4 the average silhouette_score is : 0.6505186632729437

n_clusters = 5 the average silhouette_score is : 0.56376469026194

n_clusters = 6 the average silhouette_score is : 0.4504666294372765

n_clusters 分别为 2，3，4，5，6时，sc系数如下，是介于[-1,1]之间的度量指标：

每次聚类后，每个样本都会得到一个轮廓系数，当它为1时，说明这个点与周围簇距离较远，结果非常好，当它为0，说明这个点可能处在两个簇的边界上，当值为负时，暗含该点可能被误分了。

从平均sc系数结果来看，k取3，5，6是不好的，那么2和4呢？

k=2的情况：

 

 

 k=4的情况：

 

 

 

n_clusters = 2时，第0簇的宽度远宽于第1簇；

n_clusters = 4时，所聚的簇宽度相差不大，因此选择k=4，作为最终聚类个数。

4.ch系数（calinski-harabasz index）

calinski-harabasz：

类别内部数据的协方差越小越好，类别之间的协方差越大越好（换句话说：类别内部数据的距离平方和越小越好，类别之间的距离平方和越大越好），

这样的calinski-harabasz分数s会高，分数s高则聚类效果越好。

 

 

 

tr为矩阵的迹, b_k为类别之间的协方差矩阵，w_k为类别内部数据的协方差矩阵;

m为训练集样本数，k为类别数。

 

 

 

使用矩阵的迹进行求解的理解：

矩阵的对角线可以表示一个物体的相似性

在机器学习里，主要为了获取数据的特征值，那么就是说，在任何一个矩阵计算出来之后，都可以简单化，只要获取矩阵的迹，就可以表示这一块数据的最重要的特征了，这样就可以把很多无关紧要的数据删除掉，达到简化数据，提高处理速度。

ch需要达到的目的：

​ 用尽量少的类别聚类尽量多的样本，同时获得较好的聚类效果。

5.总结

1. 肘部法

​ 下降率突然变缓时即认为是最佳的k值

2. sc系数

​ 取值为[-1, 1]，其值越大越好

3. ch系数

​ 分数s高则聚类效果越好

 

五、算法优化

1.k-means算法优点

​ 1.原理简单（靠近中心点），实现容易

​ 2.聚类效果中上（依赖k的选择）

​ 3.空间复杂度o(n)，时间复杂度o(ikn)

【注】

n个样本点个数，k个中心点个数，i为迭代次数

2.k-means算法缺点

​ 1.对离群点，噪声敏感 （中心点易偏移）

​ 2.很难发现大小差别很大的簇及进行增量计算

​ 3.结果不一定是全局最优，只能保证局部最优（与k的个数及初值选取有关）

3.canopy算法配合初始聚类

（1）流程

 

 

 （2）canopy优缺点

优点：

​ 1.kmeans对噪声抗干扰较弱，通过canopy对比，将较小的numpoint的cluster直接去掉有利于抗干扰。

​ 2.canopy选择出来的每个canopy的centerpoint作为k会更精确。

​ 3.只是针对每个canopy的内做kmeans聚类，减少相似计算的数量。

缺点：

​ 1.算法中 t1、t2的确定问题 ，依旧可能落入局部最优解

4.k-means++

 

 

 

kmeans++目的，让选择的质心尽可能的分散

如下图中，如果第一个质心选择在圆心，那么最优可能选择到的下一个点在p(a)这个区域（根据颜色进行划分）

 

 

 5.二分k-means

实现流程:

• 1.所有点作为一个簇

• 2.将该簇一分为二

• 3.选择能最大限度降低聚类代价函数（也就是误差平方和）的簇划分为两个簇。

• 4.以此进行下去，直到簇的数目等于用户给定的数目k为止。

 

 

 

隐含的一个原则

因为聚类的误差平方和能够衡量聚类性能，该值越小表示数据点越接近于他们的质心，聚类效果就越好。所以需要对误差平方和最大的簇进行再一次划分，因为误差平方和越大，表示该簇聚类效果越不好，越有可能是多个簇被当成了一个簇，所以我们首先需要对这个簇进行划分。

二分k均值算法可以加速k-means算法的执行速度，因为它的相似度计算少了并且不受初始化问题的影响，因为这里不存在随机点的选取，且每一步都保证了误差最小

6.k-medoids（k-中心聚类算法）

k-medoids和k-means是有区别的，不一样的地方在于中心点的选取

• k-means中，将中心点取为当前cluster中所有数据点的平均值，对异常点很敏感!

• k-medoids中，将从当前cluster 中选取到其他所有（当前cluster中的）点的距离之和最小的点作为中心点。

 

 

 

算法流程：

　　 ( 1 )总体n个样本点中任意选取k个点作为medoids

　　 ( 2 )按照与medoids最近的原则，将剩余的n-k个点分配到当前最佳的medoids代表的类中

　　 ( 3 )对于第i个类中除对应medoids点外的所有其他点，按顺序计算当其为新的medoids时，代价函数的值，遍历所有可能，选取代价函数最小时对应的点作为新的medoids

　　 ( 4 )重复2-3的过程，直到所有的medoids点不再发生变化或已达到设定的最大迭代次数

　　 ( 5 )产出最终确定的k个类

k-medoids对噪声鲁棒性好。

例：当一个cluster样本点只有少数几个，如（1,1）（1,2）（2,1）（1000,1000）。其中（1000,1000）是噪声。如果按照k-means质心大致会处在（1,1）（1000,1000）中间，这显然不是我们想要的。这时k-medoids就可以避免这种情况，他会在（1,1）（1,2）（2,1）（1000,1000）中选出一个样本点使cluster的绝对误差最小，计算可知一定会在前三个点中选取。

k-medoids只能对小样本起作用，样本大，速度就太慢了，当样本多的时候，少数几个噪音对k-means的质心影响也没有想象中的那么重，所以k-means的应用明显比k-medoids多。

7.kernel k-means

kernel k-means实际上，就是将每个样本进行一个投射到高维空间的处理，然后再将处理后的数据使用普通的k-means算法思想进行聚类。

 

 

 8.isodata

类别数目随着聚类过程而变化；

对类别数会进行合并，分裂，

“合并”：（当聚类结果某一类中样本数太少，或两个类间的距离太近时）

“分裂”（当聚类结果中某一类的类内方差太大，将该类进行分裂）

9.mini batch k-means

适合大数据的聚类算法

大数据量是什么量级？通常当样本量大于1万做聚类时，就需要考虑选用mini batch k-means算法。

mini batch kmeans使用了mini batch（分批处理）的方法对数据点之间的距离进行计算。

mini batch计算过程中不必使用所有的数据样本，而是从不同类别的样本中抽取一部分样本来代表各自类型进行计算。由于计算样本量少，所以会相应的减少运行时间，但另一方面抽样也必然会带来准确度的下降。

该算法的迭代步骤有两步：

(1)从数据集中随机抽取一些数据形成小批量，把他们分配给最近的质心

(2)更新质心

​ 与kmeans相比，数据的更新在每一个小的样本集上。对于每一个小批量，通过计算平均值得到更新质心，并把小批量里的数据分配给该质心，随着迭代次数的增加，这些质心的变化是逐渐减小的，直到质心稳定或者达到指定的迭代次数，停止计算。

10.总结

优化方法	思路
canopy+kmeans	canopy粗聚类配合kmeans
kmeans++	距离越远越容易成为新的质心
二分k-means	拆除sse最大的簇
k-medoids	和kmeans选取中心点的方式不同
kernel kmeans	映射到高维空间
isodata	动态聚类
mini-batch k-means	大数据集分批聚类

 

六、特征工程——特征降维

1.降维

降维是指在某些限定条件下，降低随机变量(特征)个数，得到一组“不相关”主变量的过程

• 降低随机变量的个数

 

•  相关特征(correlated feature)
  • 相对湿度与降雨量之间的相关

2.降维的两种方式

• 特征选择
• 主成分分析（可以理解一种特征提取的方式）

3.特征选择

数据中包含冗余或无关变量（或称特征、属性、指标等），旨在从原有特征中找出主要特征。

4.特征选择方法

• filter(过滤式)：主要探究特征本身特点、特征与特征和目标值之间关联
  • 方差选择法：低方差特征过滤
  • 相关系数
• embedded (嵌入式)：算法自动选择特征（特征与目标值之间的关联）
  • 决策树:信息熵、信息增益
  • 正则化：l1、l2
  • 深度学习：卷积等

5.低方差特征过滤

删除低方差的一些特征，前面讲过方差的意义。再结合方差的大小来考虑这个方式的角度。

• 特征方差小：某个特征大多样本的值比较相近
• 特征方差大：某个特征很多样本的值都有差别

api：

sklearn.feature_selection.variancethreshold(threshold = 0.0)

• 删除所有低方差特征
• variance.fit_transform(x)
  • x:numpy array格式的数据[n_samples,n_features]
  • 返回值：训练集差异低于threshold的特征将被删除。默认值是保留所有非零方差特征，即删除所有样本中具有相同值的特征。

eg.

# 有如下特征
pe_ratio,pb_ratio,market_cap,return_on_asset_net_profit,du_return_on_equity,ev,earnings_per_share,revenue,total_expense

index,pe_ratio,pb_ratio,market_cap,return_on_asset_net_profit,du_return_on_equity,ev,earnings_per_share,revenue,total_expense,date,return
0,000001.xshe,5.9572,1.1818,85252550922.0,0.8008,14.9403,1211444855670.0,2.01,20701401000.0,10882540000.0,2012-01-31,0.027657228229937388
1,000002.xshe,7.0289,1.588,84113358168.0,1.6463,7.8656,300252061695.0,0.326,29308369223.2,23783476901.2,2012-01-31,0.08235182370820669
2,000008.xshe,-262.7461,7.0003,517045520.0,-0.5678,-0.5943,770517752.56,-0.006,11679829.03,12030080.04,2012-01-31,0.09978900335112327
3,000060.xshe,16.476,3.7146,19680455995.0,5.6036,14.617,28009159184.6,0.35,9189386877.65,7935542726.05,2012-01-31,0.12159482758620697
4,000069.xshe,12.5878,2.5616,41727214853.0,2.8729,10.9097,81247380359.0,0.271,8951453490.28,7091397989.13,2012-01-31,-0.0026808154146886697

分析：

• 初始化variancethreshold,指定阀值方差
• 调用fit_transform

def variance_demo():
    """
    删除低方差特征——特征选择
    :return: none
    """
    data = pd.read_csv("factor_returns.csv")
    print(data)
    # 1、实例化一个转换器类
    transfer = variancethreshold(threshold=1)
    # 2、调用fit_transform
    data = transfer.fit_transform(data.iloc[:, 1:10])
    print("删除低方差特征的结果：\n", data)
    print("形状：\n", data.shape)

    return none

# 返回结果
            index  pe_ratio  pb_ratio    market_cap  \
0     000001.xshe    5.9572    1.1818  8.525255e+10   
1     000002.xshe    7.0289    1.5880  8.411336e+10    
...           ...       ...       ...           ...   
2316  601958.xshg   52.5408    2.4646  3.287910e+10   
2317  601989.xshg   14.2203    1.4103  5.911086e+10   

      return_on_asset_net_profit  du_return_on_equity            ev  \
0                         0.8008              14.9403  1.211445e+12   
1                         1.6463               7.8656  3.002521e+11    
...                          ...                  ...           ...   
2316                      2.7444               2.9202  3.883803e+10   
2317                      2.0383               8.6179  2.020661e+11   

      earnings_per_share       revenue  total_expense        date    return  
0                 2.0100  2.070140e+10   1.088254e+10  2012-01-31  0.027657  
1                 0.3260  2.930837e+10   2.378348e+10  2012-01-31  0.082352  
2                -0.0060  1.167983e+07   1.203008e+07  2012-01-31  0.099789   
...                  ...           ...            ...         ...       ...  
2315              0.2200  1.789082e+10   1.749295e+10  2012-11-30  0.137134  
2316              0.1210  6.465392e+09   6.009007e+09  2012-11-30  0.149167  
2317              0.2470  4.509872e+10   4.132842e+10  2012-11-30  0.183629  

[2318 rows x 12 columns]
删除低方差特征的结果：
 [[  5.95720000e+00   1.18180000e+00   8.52525509e+10 ...,   1.21144486e+12
    2.07014010e+10   1.08825400e+10]
 [  7.02890000e+00   1.58800000e+00   8.41133582e+10 ...,   3.00252062e+11
    2.93083692e+10   2.37834769e+10]
 [ -2.62746100e+02   7.00030000e+00   5.17045520e+08 ...,   7.70517753e+08
    1.16798290e+07   1.20300800e+07]
 ..., 
 [  3.95523000e+01   4.00520000e+00   1.70243430e+10 ...,   2.42081699e+10
    1.78908166e+10   1.74929478e+10]
 [  5.25408000e+01   2.46460000e+00   3.28790988e+10 ...,   3.88380258e+10
    6.46539204e+09   6.00900728e+09]
 [  1.42203000e+01   1.41030000e+00   5.91108572e+10 ...,   2.02066110e+11
    4.50987171e+10   4.13284212e+10]]
形状：
 (2318, 8)

6.相关系数

主要实现方式：

• 皮尔逊相关系数
• 斯皮尔曼相关系数

7.皮尔逊相关系数（pearson correlation coefficient）

作用：

反应变量之间相关关系密切程度的统计指标

公式：

 

 特点：

相关系数的值介于–1与+1之间，即–1≤ r ≤+1。其性质如下：

• 当r>0时，表示两变量正相关，r<0时，两变量为负相关
• 当|r|=1时，表示两变量为完全相关，当r=0时，表示两变量间无相关关系
• 当0<|r|<1时，表示两变量存在一定程度的相关。且|r|越接近1，两变量间线性关系越密切；|r|越接近于0，表示两变量的线性相关越弱
• 一般可按三级划分：|r|<0.4为低度相关；0.4≤|r|<0.7为显著性相关；0.7≤|r|<1为高度线性相关

api：

from scipy.stats import pearsonr

• x : (n,) array_like
• y : (n,) array_like returns: (pearson’s correlation coefficient, p-value)

8.斯皮尔曼相关系数（rank ic）

作用：

反应变量之间相关关系密切程度的统计指标

公式：

 

 特点：

• 斯皮尔曼相关系数表明 x (自变量) 和 y (因变量)的相关方向。 如果当x增加时， y 趋向于增加, 斯皮尔曼相关系数则为正
• 与之前的皮尔逊相关系数大小性质一样，取值 [-1, 1]之间

【注】

斯皮尔曼相关系数比皮尔逊相关系数应用更加广泛

api：

from scipy.stats import spearmanr

eg.

from scipy.stats import spearmanr

x1 = [12.5, 15.3, 23.2, 26.4, 33.5, 34.4, 39.4, 45.2, 55.4, 60.9]
x2 = [21.2, 23.9, 32.9, 34.1, 42.5, 43.2, 49.0, 52.8, 59.4, 63.5]

spearmanr(x1, x2)

# 结果
spearmanrresult(correlation=0.9999999999999999, pvalue=6.646897422032013e-64)

 9.主成分分析

• 定义：高维数据转化为低维数据的过程，在此过程中可能会舍弃原有数据、创造新的变量
• 作用：是数据维数压缩，尽可能降低原数据的维数（复杂度），损失少量信息。
• 应用：回归分析或者聚类分析当中

api：

sklearn.decomposition.pca(n_components=none)

• 将数据分解为较低维数空间
• n_components:
  • 小数：表示保留百分之多少的信息
  • 整数：减少到多少特征
• pca.fit_transform(x) x:numpy array格式的数据[n_samples,n_features]
• 返回值：转换后指定维度的array

eg.

[[2,8,4,5],
[6,3,0,8],
[5,4,9,1]]
from sklearn.decomposition import pca

def pca_demo():
    """
    对数据进行pca降维
    :return: none
    """
    data = [[2,8,4,5], [6,3,0,8], [5,4,9,1]]

    # 1、实例化pca, 小数——保留多少信息
    transfer = pca(n_components=0.9)
    # 2、调用fit_transform
    data1 = transfer.fit_transform(data)

    print("保留90%的信息，降维结果为：\n", data1)

    # 1、实例化pca, 整数——指定降维到的维数
    transfer2 = pca(n_components=3)
    # 2、调用fit_transform
    data2 = transfer2.fit_transform(data)
    print("降维到3维的结果：\n", data2)

    return none

# 结果
保留90%的信息，降维结果为：
 [[ -3.13587302e-16   3.82970843e+00]
 [ -5.74456265e+00  -1.91485422e+00]
 [  5.74456265e+00  -1.91485422e+00]]
降维到3维的结果：
 [[ -3.13587302e-16   3.82970843e+00   4.59544715e-16]
 [ -5.74456265e+00  -1.91485422e+00   4.59544715e-16]
 [  5.74456265e+00  -1.91485422e+00   4.59544715e-16]]