深度学习小技巧(二):如何保存和恢复scikit-learn训练的模型
更多深度文章,请关注云计算频道:https://yq.aliyun.com/cloud
深度学习小技巧(一):如何保存和恢复TensorFlow训练的模型
在许多情况下,在使用scikit学习库的同时,你需要将预测模型保存到文件中,然后在使用它们的时候还原它们,以便重复使用以前的工作。比如在新数据上测试模型,比较多个模型的优劣。这种保存过程也称为对象序列化——表示具有字节流的对象,以便将其存储在磁盘上,它可以通过网络发送或保存到数据库,而其恢复的过程被称为反序列化。在本文中,我们将在Python和scikit学习中看到三种可能的方法,而且每种都有其优点和缺点。
1.保存和恢复模型的工具
我们第一个介绍的工具是Pickle,用于对象(de)序列化的标准Python工具。之后,我们会介绍Joblib库,它提供了容易(de)序列化方法,其中包含了大数据数组的对象,最后我们会介绍一种手动方法来保存和恢复JSON对象(JavaScript Object Notation)。这些方法都不能代表最佳解决方案,但是可以根据项目的需要选择合适的方案。
2.模型初始化
首先,我们要创建一个scikit学习模型。在我们的例子中,我们将使用Logistic回归模型和Iris数据集。我们导入所需的库,并且加载数据,并将其拆分为训练集和测试集。
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split
# Load and split data
data = load_iris()
Xtrain, Xtest, Ytrain, Ytest = train_test_split(data.data, data.target, test_size=0.3, random_state=4)
现在让我们用一些非默认参数来创建模型,并用训练数据来“喂养”它。我们假设你先前已经找到了模型的最优参数,即产生最高估计精度的参数。
# Create a model
model = LogisticRegression(C=0.1,
max_iter=20,
fit_intercept=True,
n_jobs=3,
solver='liblinear')
model.fit(Xtrain, Ytrain)
这是我们产生的模型:
LogisticRegression(C=0.1, class_weight=None, dual=False, fit_intercept=True,
intercept_scaling=1, max_iter=20, multi_class='ovr', n_jobs=3,
penalty='l2', random_state=None, solver='liblinear', tol=0.0001,
verbose=0, warm_start=False)
使用该fit
方法,模型已经学习了存储在其中的系数model.coef_
。目标是将模型的参数和系数保存到文件中,因此你不需要再次对新数据重复模型训练和参数优化的步骤。
3.Pickle模块
在以下几行代码中,我们将上一步中创建的模型保存到文件中,然后作为一个新对象加载pickled_model
。然后使用加载的模型计算准确度分数,并对新的未见(测试)数据进行预测结果。
import pickle
#
# Create your model here (same as above)
#
# Save to file in the current working directory
pkl_filename = "pickle_model.pkl"
with open(pkl_filename, 'wb') as file:
pickle.dump(model, file)
# Load from file
with open(pkl_filename, 'rb') as file:
pickle_model = pickle.load(file)
# Calculate the accuracy score and predict target values
score = pickle_model.score(Xtest, Ytest)
print("Test score: {0:.2f} %".format(100 * score))
Ypredict = pickle_model.predict(Xtest)
运行此代码应该会产生你的预测分数,并通过Pickle保存模型:
$ python save_model_pickle.py
Test score: 91.11 %
使用Pickle来保存和恢复学习模型的好处在于它很快,并且你可以用两行代码完成。如果你已经对训练数据上的模型参数进行了优化,那么这是非常有用的,因此你不需要重复此步骤。不管如何,它都不保存测试结果和任何数据。但仍然可以保存多个对象的元组或列表(并记住哪个对象在哪里),如下所示:
tuple_objects = (model, Xtrain, Ytrain, score)
# Save tuple
pickle.dump(tuple_objects, open("tuple_model.pkl", 'wb'))
# Restore tuple
pickled_model, pickled_Xtrain, pickled_Ytrain, pickled_score = pickle.load(open("tuple_model.pkl", 'rb'))
3.Joblib模块
Joblib库它的目的是替代Pickle,用于包含大数据的对象。我们将重复与Pickle一样的保存和恢复过程。
from sklearn.externals import joblib
# Save to file in the current working directory
joblib_file = "joblib_model.pkl"
joblib.dump(model, joblib_file)
# Load from file
joblib_model = joblib.load(joblib_file)
# Calculate the accuracy and predictions
score = joblib_model.score(Xtest, Ytest)
print("Test score: {0:.2f} %".format(100 * score))
Ypredict = pickle_model.predict(Xtest)
$ python save_model_joblib.py
Test score: 91.11 %
从示例中可以看出,与Pickle相比,Joblib库提供了一个简单的工作流程。虽然Pickle要求将文件对象作为参数传递,但是Joblib可与文件对象和字符串文件名一起使用。如果你的模型包含大量数据,则每个数组将存储在单独的文件中,但整体的保存和恢复过程将保持不变。Joblib还允许使用不同的压缩方法,如“zlib”,“gzip”,“bz2”和不同的压缩级别。
4.手动保存并还原到JSON
根据你的项目,很多时候你会发现Pickle和Joblib都不是合适的解决方案。其中一些原因将在兼容性问题部分中稍后讨论。无论何时要想完全控制保存和恢复过程,最好的方法是手动构建自己的功能。
以下显示了使用JSON手动保存和恢复对象的示例。这种方法允许我们选择需要保存的数据,例如模型参数,系数,训练数据以及我们需要的任何其他数据。
由于我们想将所有这些数据保存在一个对象中,所以一个可能的方法是创建一个继承我们的示例中的模型类的新类LogisticRegression
。这个新类被MyLogReg
调用,然后分别实现save_json
和load_json
的
方法以保存和恢复JSON文件。
为简单起见,我们将只保存三个模型参数和训练数据。我们可以用这种方法存储一些额外的数据,例如训练集上的交叉验证分数,测试数据,测试数据的准确度等等。
import json
import numpy as np
class MyLogReg(LogisticRegression):
# Override the class constructor
def __init__(self, C=1.0, solver='liblinear', max_iter=100, X_train=None, Y_train=None):
LogisticRegression.__init__(self, C=C, solver=solver, max_iter=max_iter)
self.X_train = X_train
self.Y_train = Y_train
# A method for saving object data to JSON file
def save_json(self, filepath):
dict_ = {}
dict_['C'] = self.C
dict_['max_iter'] = self.max_iter
dict_['solver'] = self.solver
dict_['X_train'] = self.X_train.tolist() if self.X_train is not None else 'None'
dict_['Y_train'] = self.Y_train.tolist() if self.Y_train is not None else 'None'
# Creat json and save to file
json_txt = json.dumps(dict_, indent=4)
with open(filepath, 'w') as file:
file.write(json_txt)
# A method for loading data from JSON file
def load_json(self, filepath):
with open(filepath, 'r') as file:
dict_ = json.load(file)
self.C = dict_['C']
self.max_iter = dict_['max_iter']
self.solver = dict_['solver']
self.X_train = np.asarray(dict_['X_train']) if dict_['X_train'] != 'None' else None
self.Y_train = np.asarray(dict_['Y_train']) if dict_['Y_train'] != 'None' else None
现在我们来试一试MyLogReg
。首先我们创建一个对象mylogreg
,将训练数据传递给它,并将其保存到文件中。然后我们创建一个新对象json_mylogreg
,
并调用该load_json
方法从文件加载数据。
filepath = "mylogreg.json"
# Create a model and train it
mylogreg = MyLogReg(X_train=Xtrain, Y_train=Ytrain)
mylogreg.save_json(filepath)
# Create a new object and load its data from JSON file
json_mylogreg = MyLogReg()
json_mylogreg.load_json(filepath)
json_mylogreg
打印出新的对象,我们可以根据需要来查看我们的参数和训练数据。
MyLogReg(C=1.0,
X_train=array([[ 4.3, 3. , 1.1, 0.1],
[ 5.7, 4.4, 1.5, 0.4],
...,
[ 7.2, 3. , 5.8, 1.6],
[ 7.7, 2.8, 6.7, 2. ]]),
Y_train=array([0, 0, ..., 2, 2]), class_weight=None, dual=False,
fit_intercept=True, intercept_scaling=1, max_iter=100,
multi_class='ovr', n_jobs=1, penalty='l2', random_state=None,
solver='liblinear', tol=0.0001, verbose=0, warm_start=False)
由于使用JSON的数据序列化实际上是将对象保存为字符串格式,而不是字节流,所以'mylogreg.json'文件可以使用文本编辑器打开和修改。虽然这种方法对开发人员来说很方便,但是由于入侵者可以查看和修改JSON文件的内容,因此安全性较低。此外,这种方法更适合于具有少量实例变量的对象,例如scikit-learn模型,因为任何添加新变量都需要在保存和恢复方法中进行更改。
5.兼容性问题
尽管到目前为止,每个工具的优点和缺点已被介绍,但Pickle和Joblib工具的最大缺点可能是其与不同型号的Python版本的兼容性。
5.1:Python版本的兼容性——两种工具的文档都指出,不建议(de)在不同的Python版本之间对对象进行序列化,尽管它可能在低级的版本更改中起作用。
5.2:模型兼容性——最常见的错误之一是使用Pickle或Joblib保存模型,然后在尝试从文件还原之前更改模型。模型的内部结构需要在保存和重新加载之间保持不变。
Pickle和Joblib的最后一个问题与安全性有关。这两种工具都可能包含恶意代码,因此不建议从不受信任或未经身份验证的源代码。
6.结论
在这篇文章中,我们描述了三种保存和恢复scikit学习模型的工具。Pickle和Joblib库可以快速方便地使用,但是在不同的Python版本和学习模型的变化中存在兼容性问题。另一方面,手动方法更难实现,需要在模型结构发生任何变化中进行修改,但在另一方面,它可以轻松地适应各种需求,并且没有任何兼容性问题。
作者信息
作者:Mihajlo Pavloski,数据科学与机器学习的爱好者,博士生。
本文由阿里云云栖社区组织翻译。
文章原标题《TensorFlow : Save and Restore Models》
作者:Mihajlo Pavloski 译者:虎说八道,审阅:
文章为简译,更为详细的内容,请查看原文