RDKit | 基于片段的分子生成（骨架A+骨架B）

• 通过BRICS算法产生片段库
• 通过结合两个片段（A，B）生成了一个新分子（AB）。

 

环境

• Win10
• RDKit2020.09.1
• Python=3.7.9

基于双片段的分子生成

导入库

import numpy as np
from rdkit import rdBase, Chem
from rdkit.Chem import AllChem, Draw, BRICS, Descriptors
from rdkit.ML.Descriptors import MoleculeDescriptors
print(rdBase.rdkitVersion)

2020.09.1

载入数据 

suppl = Chem.SDMolSupplier('logSdataset1290_2d.sdf')
mols_list = [mo

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