pytorch 运行一段时间后出现GPU OOM的问题
pytorch的dataloader会将数据传到gpu上,这个过程gpu的mem占用会逐渐增加,为了避免gpumen被无用的数据占用,可以在每个step后用del删除一些变量,也可以使用torch.cuda.empty_cache()释放显存:
del targets, input_k, input_mask torch.cuda.empty_cache()
这时能观察到gpu的显存一直在动态变化。
但是上述方式不是一个根本的解决方案,因为他受到峰值的影响很大。比如某个batch的数据量明显大于其他batch,可能模型处理该batch时显存会不够用,这也会导致oom,虽然其他的batch都能顺利执行。
显存的占用跟这几个因素相关:
模型参数量
batch size
一个batch的数据 size
通常我们不希望改变模型参数量,所以只能通过动态调整batch-size,使得一个batch的数据 size不会导致显存oom:
ilen = int(sorted_data[start][1]['input'][0]['shape'][0]) olen = int(sorted_data[start][1]['output'][0]['shape'][0]) # if ilen = 1000 and max_length_in = 800 # then b = batchsize / 2 # and max(1, .) avoids batchsize = 0 # 太长的句子会被动态改变bsz,单独成一个batch,否则padding的部分就太多了,数据量太大,oom factor = max(int(ilen / max_length_in), int(olen / max_length_out)) b = max(1, int(batch_size / (1 + factor))) #b = batch_size end = min(len(sorted_data), start + b) minibatch.append(sorted_data[start:end]) if end == len(sorted_data): break start = end
此外,如何选择一个合适的batchsize也是个很重要的问题,我们可以先对所有数据按照大小(长短)排好序(降序),不进行shuffle,按照64,32,16依次尝试bsz,如果模型在执行第一个batch的时候没出现oom,那么以后一定也不会出现oom(因为降序排列了数据,所以前面的batch的数据size最大)。
还有以下问题
pytorch increasing cuda memory oom 问题
改了点model 的计算方式,然后就 oom 了,调小了 batch_size,然后发现发现是模型每次迭代都会动态增长 cuda memory, 在排除了 python code 中的潜在内存溢出问题之后,基本可以把问题定在 pytorch 的图计算问题上了,说明每次迭代都重新生成了一张计算图,然后都保存着在,就 oom 了。
参考
cuda memory continuously increases when net(images) called in every iteration
understanding graphs and state
说是会生成多个计算图:
loss = somelossfunction(out) + somelossfunction(out)
准备用 sum来避免多次生成计算图的问题:
loss = variable(torch.sum(torch.cat([loss1, loss2], 0)))
然而,调着调着就好了,和报错前的 code 没太大差别。估计的原因是在pycharm 远程连接服务器的时候 code 的保存版本差异问题,这个也需要解决一下。
还有个多次迭代再计算梯度的问题,类似于 caffe中的iter_size,这个再仔细看看。
以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持。
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