Cy菁染料活性酯的分子量光谱及溶解度介绍
菁染料是近红外荧光染料中常用的一类荧光染料，有显著的优势。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段小，因此在检测复杂生物系统时，近红外染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时，由于光波在近红外区段的组织透过性更好。
产品说明：
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是非常高的，其琥珀酰亚胺酯是常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度，可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman 规则正好红移约100nm。
磺酸化菁染料和非磺酸化菁荧光染料可以用于标记各种不同的目标分子：
l 可在有机溶剂中溶解的蛋白质
l 抗体 (use 5-10% of DMSO/DMF)
l DNA和寡核苷酸
l 多肽
l 其他小分子，包括药用小分子及抑制剂
磺酸化菁荧光染料可用于：
Ø 在DMF或DMSO中变性的敏感蛋白
Ø 被透析及纯化的蛋白
Ø 水溶性的纳米粒子
Ø 不溶或疏水的蛋白
非磺酸化菁荧光染料可用于：
Ø 在有机介质反应（二氯甲烷、乙腈）
Cy3 NHS ester （CY3,SE）
Cyanine 是一种属于聚甲炔基的合成染料,仍用于工业以增加感光乳剂的感光范围(例如增加
波长范围且使薄膜全色),近用于生物技术领域.作为荧光染料,Cyanine 已用于生物医学成
像.根据它们的结构,cyanines 能覆盖 UV 到 IR 的光谱范围.
Cyanine3 NHS ester 可用作反应性染料,用于标记生物分子中的氨基。该试剂通常用于标记可溶性蛋白\多肽\寡核苷酸或 DNA. Cy3 NHS ester 需要使用有机
共溶剂(例如 DMF 或 DMSO)用于标记,然而,考虑到水溶性 sulfo-Cyanine3 NHS ester 在精细蛋白中的使用,此类共溶剂不是必需的.Cy3 荧光位于橙色区域(~550 nm 激发, ~570 nm 发射),而Cy5 是在红色区域发光(~650/670 nm),且在橙色区域吸收(~649 nm).Cy3 可以通过配有标准的TRITC 滤波器的荧光计\成像仪及显微镜检测.由于其固有的高消光系数,甚肉眼也可以很容易地检测到凝胶和溶液中的 Cy3.
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产品名称 |
Cy3 NHS ester |
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英文名称 |
(2E)-1-[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethyl-5-sulfonatoindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indole-5-sulfonate |
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Canonical SMILES |
CC1(C2=C(C=CC(=C2)S(=O)(=O)[O-])[N+](=C1C=CC=C3C(C4=C(N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)C=CC(=C4)S(=O)(=O)[O-])(C)C)C)C |
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分子式 |
C34H38N3NaO10S2 |
分子量 |
735.80 |
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溶解度 |
very high in water, good in polar organic solvents (DMF, DMSO) |
储存条件 |
在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。 |
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更高要求 |
为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。 |
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Spectral properties
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光谱信息 大激发波长 (nm) |
584 |
大发射波长 (nm) |
563 |
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在大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1 |
162000 |
荧光量子产率 |
0.1 |
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CF260 |
0.03 |
CF280 |
0.06 |
Cy3.5 NHS ester （CY3.5,SE）
Cy3.5 NHS ester是一种活性染料，用于标记生物分子中的氨基，Cy3.5®NHS酯的类似物。该试剂是用于标记可溶性蛋白、肽和寡核苷酸/ DNA的理想试剂。溶解于有机溶剂DMSO，对于微妙的蛋白质考虑使用水溶性CY3.5-NHS酯，不需要使用任何共溶剂。
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化学名称 |
Cy3.5 NHS ester |
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英文名称 |
2-((1E,3E)-3-(3-butyl-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)prop-1-en-1-yl)-3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-3-ium |
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Canonical SMILES |
CC1(C)C2=C3C(C=CC=C3)=CC=C2[N+](CCCCCC(ON4C(CCC4=O)=O)=O)=C1/C=C/C=C5C(C)(C)C6=C(C=CC=C7)C7=CC=C6N\5CCCC |
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分子式 |
C42H44ClN3O4 |
分子量 |
690.27 |
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溶解度 |
>69.6mg/mL in DMSO |
储存条件 |
在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。 |
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更高要求 |
为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。 |
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光谱信息 大激发波长 (nm) |
591 |
大发射波长 (nm) |
604 |
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在大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1 |
116000 |
荧光量子产率 |
0.35 |
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CF260 |
0.29 |
CF280 |
0.22 |
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Cy5 NHS ester （CY5,SE）
在过去的几年中，cy5已经成为生命科学研究和诊断领域的一个非常受欢迎的标签。荧光团在红色区域发射大，其中许多CCD探测器表现出大的灵敏度，荧光明亮。
Cy5 NHS ester是用于标记肽、蛋白质和核苷酸中的氨基的活性染料。这种染料需要少量的有机共溶剂（如DMF或DMSO）用于标记反应。该试剂是非常可贵的有效标记的可溶性蛋白以及各种肽和核苷酸的理想试剂。该试剂也适用于小分子标记的有机溶剂。对于更复杂的目标，如易降解的蛋白质，当使用DMF或DMSO是不可取的，考虑使用水溶性Cy5 NHS ester，它不需要任何共溶剂，并且具有非常相似的荧光性质。
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化学名称 |
CY5 NHS |
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英文名称 |
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2E)-3,3-dimethyl-2-[(2E,4E)-5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanoate |
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CAS: |
1032678-42-4 |
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Canonical SMILES |
CC1(C2=CC=CC=C2[N+](=C1C=CC=CC=C3C(C4=CC=CC=C4N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)(C)C)C)C |
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分子式 |
C36H42ClN3O4 |
分子量 |
616.19 |
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溶解度 |
>31.5mg/mL in DMSO |
储存条件 |
在- 20°C的黑暗环境中保存24个月。运输：室温下长达3周。避免长时间暴露在光线下。干燥剂。. |
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更高要求 |
为了获得更高的溶解度，请将管在37℃加热并在超声波浴中摇晃一段时间，原液可储存在20℃以下几个月。 |
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光谱信息 大激发波长 (nm) |
646 |
大发射波长 (nm) |
662 |
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在大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1 |
250000 |
荧光量子产率 |
0.2 |
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CF260 |
0.03 |
CF280 |
0.04 |
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